MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725 chromosome

Total Repeats: 10942

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012034	A	6	6	1611	1616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012034	T	6	6	2740	2745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012034	T	9	9	3828	3836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012034	GAA	2	6	6241	6246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012034	TTG	2	6	6306	6311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012034	A	6	6	6318	6323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012034	CTG	2	6	6368	6373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012034	TTGA	2	8	6444	6451	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012034	AAT	2	6	8907	8912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012034	T	6	6	8962	8967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012034	AAT	2	6	8974	8979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012034	TTA	2	6	8986	8991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012034	ATT	2	6	9019	9024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012034	T	6	6	9039	9044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012034	A	6	6	9051	9056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012034	CAA	2	6	9069	9074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012034	T	6	6	9078	9083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012034	ATA	2	6	9094	9099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012034	AATTG	2	10	9113	9122	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012034	TAA	3	9	9123	9131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012034	A	6	6	9161	9166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012034	GAT	2	6	11105	11110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012034	A	6	6	11111	11116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012034	AGG	2	6	11167	11172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012034	TGC	2	6	11335	11340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012034	AG	3	6	11366	11371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012034	TAA	2	6	11397	11402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012034	A	7	7	11519	11525	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012034	ATTCA	2	10	11562	11571	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_012034	ATT	2	6	11653	11658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012034	GAAG	2	8	11669	11676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012034	ATT	2	6	11710	11715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012034	GAG	2	6	11726	11731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012034	A	6	6	11777	11782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012034	A	8	8	11825	11832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012034	TGG	2	6	11883	11888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012034	TTA	2	6	11924	11929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012034	ATG	2	6	11941	11946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012034	TAA	2	6	12019	12024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012034	AT	3	6	12088	12093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012034	TA	3	6	12119	12124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012034	A	6	6	12129	12134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012034	ATT	2	6	12146	12151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012034	T	7	7	12150	12156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012034	T	6	6	12171	12176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012034	TCT	2	6	12186	12191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012034	CAA	2	6	12206	12211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012034	ATT	2	6	12220	12225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012034	GAAA	2	8	12246	12253	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012034	A	6	6	12251	12256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012034	A	6	6	12275	12280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012034	GA	3	6	12319	12324	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012034	CAA	2	6	12458	12463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012034	T	7	7	12487	12493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012034	AAG	2	6	12522	12527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012034	AAT	2	6	12544	12549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012034	T	6	6	12560	12565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012034	ATT	2	6	12568	12573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012034	TAC	2	6	12582	12587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012034	TA	3	6	12593	12598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012034	TAAA	2	8	12607	12614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012034	ATT	2	6	12618	12623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012034	AGT	2	6	21733	21738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012034	AGTTT	2	10	21799	21808	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012034	ATAA	2	8	23887	23894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012034	A	6	6	23915	23920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012034	ATAGA	2	10	23925	23934	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012034	CAAG	2	8	23943	23950	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_012034	AGA	2	6	24202	24207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012034	GAT	2	6	24244	24249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012034	ATATT	2	10	24256	24265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012034	AGTTT	2	10	24279	24288	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012034	AG	3	6	24304	24309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012034	T	7	7	26540	26546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012034	GTTAT	2	10	26611	26620	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012034	GCG	2	6	26664	26669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012034	GTAA	2	8	26684	26691	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012034	T	6	6	26747	26752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012034	TTC	2	6	26808	26813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012034	GGA	2	6	26937	26942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012034	GTCT	2	8	26954	26961	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_012034	TCT	2	6	26986	26991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012034	TCA	2	6	27094	27099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_012034	GAA	2	6	27183	27188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012034	T	6	6	27210	27215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012034	ACA	2	6	27238	27243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012034	AAT	2	6	27300	27305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012034	TTTG	2	8	27335	27342	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012034	AAT	2	6	27343	27348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012034	TCT	2	6	27367	27372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012034	AAG	2	6	27473	27478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012034	AGA	2	6	27515	27520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012034	GTT	2	6	27706	27711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012034	T	6	6	27710	27715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012034	GA	3	6	27762	27767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012034	AAG	2	6	29895	29900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012034	TAG	2	6	30420	30425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012034	AAT	2	6	30434	30439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012034	TTAAA	2	10	30449	30458	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012034	CTT	2	6	30464	30469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012034	T	6	6	30509	30514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012034	TTG	2	6	30601	30606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012034	TA	3	6	30665	30670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012034	CT	3	6	30784	30789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_012034	ACA	2	6	30841	30846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012034	TTTA	2	8	30855	30862	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012034	AT	3	6	30918	30923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012034	AAT	2	6	30963	30968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012034	TGT	2	6	31226	31231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012034	CAT	2	6	31246	31251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012034	TTC	2	6	31271	31276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_012034	GTA	2	6	31300	31305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012034	T	6	6	31362	31367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012034	ATA	2	6	31410	31415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012034	AAG	2	6	31461	31466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012034	ATT	2	6	31490	31495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012034	CA	3	6	33992	33997	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_012034	T	6	6	34008	34013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012034	ATT	2	6	34023	34028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012034	CAAA	2	8	34052	34059	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_012034	GAG	2	6	34091	34096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012034	A	6	6	34097	34102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012034	A	6	6	34142	34147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012034	TTA	2	6	34159	34164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012034	TAA	2	6	34197	34202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012034	A	6	6	34210	34215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012034	GA	3	6	34912	34917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012034	CT	3	6	34944	34949	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_012034	T	6	6	34974	34979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012034	GATTA	2	10	34992	35001	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012034	A	6	6	35030	35035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012034	GTAAAA	2	12	35070	35081	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012034	A	7	7	35078	35084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012034	ATA	2	6	35094	35099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012034	A	6	6	35103	35108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012034	AGA	2	6	35114	35119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012034	GAG	2	6	35126	35131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012034	T	6	6	35134	35139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012034	TAT	2	6	35759	35764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012034	AAT	2	6	35867	35872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012034	TTG	2	6	35876	35881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012034	ATTT	2	8	35897	35904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012034	TTG	2	6	35912	35917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012034	TTA	2	6	35986	35991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_012034	AAAG	2	8	36727	36734	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012034	TGG	2	6	36775	36780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012034	AAG	2	6	36790	36795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012034	AAG	2	6	36812	36817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_012034	GCT	2	6	36832	36837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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151	NC_012034	AGC	2	6	36847	36852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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153	NC_012034	TTA	2	6	38768	38773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_012034	T	6	6	38939	38944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_012034	TCC	2	6	42081	42086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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168	NC_012034	A	6	6	42157	42162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_012034	A	7	7	48743	48749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_012034	AG	3	6	48769	48774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
186	NC_012034	ATAA	2	8	48784	48791	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_012034	TAA	2	6	48797	48802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_012034	T	8	8	62430	62437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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290	NC_012034	AAT	2	6	88232	88237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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440	NC_012034	A	7	7	117841	117847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_012034	A	6	6	117863	117868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_012034	T	7	7	119053	119059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_012034	GT	3	6	119060	119065	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
444	NC_012034	ATA	2	6	119131	119136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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446	NC_012034	ATAA	2	8	120541	120548	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_012034	TGGG	2	8	120551	120558	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
448	NC_012034	TTG	2	6	120606	120611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
449	NC_012034	TAGCT	2	10	120718	120727	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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451	NC_012034	ATG	2	6	120789	120794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_012034	A	8	8	120937	120944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_012034	TGA	2	6	121052	121057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
460	NC_012034	ATA	3	9	121173	121181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_012034	T	6	6	121242	121247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_012034	GCAC	2	8	121262	121269	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
463	NC_012034	CTG	2	6	121276	121281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
464	NC_012034	A	7	7	121292	121298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_012034	TCA	2	6	121364	121369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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476	NC_012034	AG	3	6	121641	121646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
477	NC_012034	TAT	2	6	121647	121652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
478	NC_012034	GCA	2	6	121659	121664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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483	NC_012034	ATT	2	6	121795	121800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_012034	TAAA	2	8	121851	121858	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_012034	CAA	2	6	127817	127822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
489	NC_012034	AC	3	6	127840	127845	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
490	NC_012034	T	6	6	127861	127866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_012034	A	6	6	127873	127878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_012034	TAA	2	6	127905	127910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_012034	CCA	2	6	127913	127918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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495	NC_012034	CAAA	2	8	127978	127985	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
496	NC_012034	A	7	7	127983	127989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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